54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2161 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  54.77 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  49.32 
 
 		 293 aa  298  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  50.87 
 
 		 288 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  47.54 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  44.72 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  42.96 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  46.94 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  39.05 
 
 		 371 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  36.13 
 
 		 326 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  40.39 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  31.16 
 
 		 348 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  31.64 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  34.82 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  32.08 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  31.02 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  30.48 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  30.86 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  29.74 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  28.11 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  31.48 
 
 		 359 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  27.01 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  31.25 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  27.07 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  28.94 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  29.33 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  26.38 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  27.06 
 
 		 1320 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  27.23 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  26.79 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  25.56 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  29.79 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29260  panthothenate kinase  29.37 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1293  hypothetical protein  36.23 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 229 aa  48.9  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  26.19 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6929  hypothetical protein  28.68 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  30.93 
 
 		 198 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1603  pantothenate kinase  24.63 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  28.45 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5968  putative fructose transport system kinase  27.07 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3739  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3894  pantothenate kinase  29.69 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0154939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0832  pantothenate kinase  23.42 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3611  putative fructose transport system kinase  32.46 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.66248 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39804  Predicted panthothenate kinase/uridine kinase-related protein  28.47 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0416913 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  30.83 
 
 		 504 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0128  pantothenate kinase  28.33 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814867  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2087  pantothenate kinase  25.62 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.222061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  29.63 
 
 		 206 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2007  pantothenate kinase  25.62 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0772571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4273  putative fructose transport system kinase  28.81 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>