36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0248 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_09161  putative kinase  94.35 
 
 		 336 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0248  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  100 
 
 		 336 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.270225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06771  putative kinase  44.55 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.436834  normal  0.433504 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08971  putative kinase  47.23 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10421  putative kinase  46.49 
 
 		 313 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.200002  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0840  putative kinase  46.69 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0133007  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14561  putative kinase  39.53 
 
 		 352 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08991  putative kinase  46.13 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.962103  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  38.64 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1321  hypothetical protein  38.91 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0770352 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38956  predicted protein  31.25 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.591207  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3799  glycerate kinase  26.81 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.390392  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0996  glycerate kinase  27.56 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.731332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0459  Glycerate kinase  25.28 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362414  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3034  hypothetical protein  27.71 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.615757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0354  glycerate kinase  26.94 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1031  glycerate kinase  26.5 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1967  hypothetical protein  27.16 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5068  hypothetical protein  24.35 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1940  glycerate kinase  26.61 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1408  hypothetical protein  28.51 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2161  hypothetical protein  28.94 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07108  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.769324  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3207  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00210  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02158  kinase-like protein  26.22 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0521  hypothetical protein  27.31 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1871  kinase-like protein  27 
 
 		 255 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  24.37 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0509  hypothetical protein  25.28 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.44966  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41282  predicted protein  30.35 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0347701  normal  0.0262315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0494  kinase-like  26.72 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3783  hypothetical protein  33.78 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.492167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  29.27 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01280  actin cross-linking, putative  26.86 
 
 		 1320 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  28.45 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>