141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0965 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  54.3 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  52.15 
 
 		 198 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  51.83 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  34.36 
 
 		 195 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  38.95 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  36.41 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  33.69 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  34.46 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  30.81 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  29.95 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  29.95 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  30.3 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  29.8 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  30.73 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  29.95 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  30.81 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  28.5 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  28.43 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  28.14 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  27.18 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  27.72 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  25.13 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  27.72 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  27.72 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  27.72 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  29.67 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  26.06 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  27.47 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  28.72 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  28.02 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  29.57 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  29.53 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  27.93 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  26.92 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  26.92 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  25.13 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.73 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  27.07 
 
 		 719 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  26.74 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  28.33 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  28.33 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.35 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.88 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  28.93 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  24.14 
 
 		 682 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  28.43 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  28.43 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  24.32 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  29.41 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  25.59 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  24.72 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  25.53 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02150  uridine kinase, putative  26.42 
 
 		 582 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  26.6 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  28.64 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0794  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.74 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0142464  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  25.13 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  27.98 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  22.22 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  21.74 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  21.74 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  25.13 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  25.9 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0422  uridine kinase  25.6 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.174111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3499  pantothenate kinase  25.68 
 
 		 330 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  27.59 
 
 		 504 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  27.37 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  26.04 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  28.99 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5127  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.73 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  24.48 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  26.71 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  26.67 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.95 
 
 		 325 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2275  pantothenate kinase  26.14 
 
 		 319 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1674  pantothenate kinase  26.24 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0576097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  23.5 
 
 		 334 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43015  predicted protein  26.14 
 
 		 526 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.239566  hitchhiker  0.00935325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  25.25 
 
 		 213 aa  44.7  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  23.68 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1862  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.5 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  26.38 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_47740  predicted protein  29.17 
 
 		 434 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  26.59 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  26.62 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  25.91 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  24.49 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  25.91 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0975  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.71 
 
 		 343 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  25.39 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0315  uridine kinase  32.53 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4429  phosphoribulokinase  23.08 
 
 		 313 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000782103  normal  0.086912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  23.23 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>