34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2365 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  371  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  54.12 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  55 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  57.56 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  49.72 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  49.38 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  37.43 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  46.11 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  47.47 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  40.91 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  44.83 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  44.83 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  44.83 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  33.53 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  32.37 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  35.26 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  42.29 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  34.25 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  39.39 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  33.33 
 
 		 682 aa  82.8  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  36.56 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  31.71 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.93 
 
 		 719 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  35.22 
 
 		 156 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  40.74 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  35.79 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  32.74 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  32.74 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  33.15 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  29.78 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  33.56 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  29.08 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  31.29 
 
 		 226 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2093  hypothetical protein  36.08 
 
 		 179 aa  42  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>