49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0439 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  62.73 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  53.25 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  52.83 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  40.83 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  41.24 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  43.09 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  34.34 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  33.13 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  31.55 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  26.94 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.42 
 
 		 719 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  27.04 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  31.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  28.66 
 
 		 682 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  33.81 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  36.13 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  36.13 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  35.48 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  32.24 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  32.17 
 
 		 565 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  33.77 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  32.56 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 554 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 554 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  29.57 
 
 		 547 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3321  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.49 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.29 
 
 		 292 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  26.4 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  29.66 
 
 		 573 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  28.95 
 
 		 553 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  36 
 
 		 255 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.26 
 
 		 358 aa  41.6  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  34.21 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.32 
 
 		 207 aa  41.2  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  32.35 
 
 		 559 aa  41.6  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  26.42 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  29.34 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>