More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0668 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  87.95 
 
 		 255 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  79.53 
 
 		 254 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  50.2 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  53.41 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 250 aa  232  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  49.19 
 
 		 270 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  60.63 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  47.58 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 244 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  41.53 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  43.55 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0879  ABC transporter related  43.67 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  49.56 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.72 
 
 		 304 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.9 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1182  ABC transporter related  44.92 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.7 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.72 
 
 		 303 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.72 
 
 		 303 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.72 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  43.88 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  41.3 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.04 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.45 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4786  ABC transporter related  41.56 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  45.5 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  38.49 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.06 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.04 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0478  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.04 
 
 		 291 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.46 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  40.55 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  41.45 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  40.76 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  40.16 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  41.83 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.08 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  47.16 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  41.11 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.43 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  46.7 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  46.7 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.43 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  41.6 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  46.7 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.45 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.62 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1443  ABC transporter related  42.45 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.605121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.35 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  42.15 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  43.72 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  39.29 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  43.67 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  39.69 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  36.44 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  42 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.62 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  39.84 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  40.16 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.66 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.79 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  35.83 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 254 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  42.86 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.84 
 
 		 271 aa  181  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>