More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3100 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  54.51 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  54.37 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  55.64 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 281 aa  274  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.83 
 
 		 275 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  55.33 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  53.2 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  53.7 
 
 		 271 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  53.54 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  53.54 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  53.1 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  50.98 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  50.98 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.88 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  50 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  47.86 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.12 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  54.22 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  50 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  50 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  54.98 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  50.97 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  52.21 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  46.9 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  54.39 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  54.96 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  53.51 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  48.78 
 
 		 278 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.21 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.11 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.72 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  52.74 
 
 		 257 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.35 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  46.27 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.33 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  55.75 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.44 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.05 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  49.79 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.61 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  50.59 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.73 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.7 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.08 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.63 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.98 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.85 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.31 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.51 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.96 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.75 
 
 		 246 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  48.86 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.98 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.06 
 
 		 261 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.85 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  50.88 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.21 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.19 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.49 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.22 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.55 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  51.68 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.02 
 
 		 258 aa  225  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  48.05 
 
 		 272 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.05 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  50.44 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.56 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  49.58 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.27 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  50 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.95 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.59 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.84 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.66 
 
 		 272 aa  222  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  47.97 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  53.52 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  51.74 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.72 
 
 		 275 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.34 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  49.38 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  54.81 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.48 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>