More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2836 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  82.72 
 
 		 272 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  65.04 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  61.38 
 
 		 260 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  60.98 
 
 		 259 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  57.89 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  52.67 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  52.67 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  52.67 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  51.85 
 
 		 287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  53.75 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  52.52 
 
 		 267 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  51.97 
 
 		 283 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 253 aa  268  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  51.25 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.67 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.39 
 
 		 254 aa  266  4e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.08 
 
 		 271 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.8 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  53.19 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.25 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  50.42 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  54.08 
 
 		 267 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  51.06 
 
 		 304 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 272 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  50.42 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  51.67 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.78 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.8 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  52.97 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 254 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  55.95 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.97 
 
 		 304 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  48.58 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.79 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  49.8 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.91 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  54.46 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.63 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  54.67 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  50.2 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.8 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.37 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.15 
 
 		 258 aa  246  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  52.68 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  49.57 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.57 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.57 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.19 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  50.67 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.21 
 
 		 286 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.79 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.21 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.95 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  52.19 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.98 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.6 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.38 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.81 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.41 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.35 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.74 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.56 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.86 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.24 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.29 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.6 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  45.7 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.22 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.75 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  47.9 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  48.09 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50.22 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.97 
 
 		 287 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.39 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  53.85 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.32 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.32 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.56 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.96 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  49.17 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.68 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.33 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  49.59 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.97 
 
 		 259 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.12 
 
 		 282 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.06 
 
 		 663 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  49.78 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>