More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1262 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  89.58 
 
 		 260 aa  477  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  84.94 
 
 		 259 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  60.98 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  60.16 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  52.03 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  51.42 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.7 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.94 
 
 		 269 aa  268  8.999999999999999e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  52.23 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  50.97 
 
 		 263 aa  261  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50.39 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.23 
 
 		 304 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.74 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  51 
 
 		 289 aa  258  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.39 
 
 		 271 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  50.79 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50.79 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  52.03 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50.39 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.01 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.2 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.6 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.81 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.56 
 
 		 303 aa  251  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.74 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  54.58 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.2 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.58 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  52.79 
 
 		 263 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.35 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  47.92 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.99 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.39 
 
 		 253 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.37 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.5 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.31 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.41 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.04 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.17 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.8 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.09 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  53.54 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.82 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  51.2 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.72 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  49.79 
 
 		 267 aa  235  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.03 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  52.21 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  54.46 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.01 
 
 		 315 aa  234  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  49.35 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  48.78 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.83 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  47.52 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.12 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.6 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  50.21 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 272 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.83 
 
 		 253 aa  232  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.59 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50 
 
 		 286 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.59 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  47.13 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  49.61 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  46.12 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  50.38 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.39 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  49.35 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  51.3 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.58 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.66 
 
 		 277 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.79 
 
 		 260 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.71 
 
 		 265 aa  228  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.88 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  47.86 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.36 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.39 
 
 		 283 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  44.53 
 
 		 273 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  44.35 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>