More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3906 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  100 
 
 		 315 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3728  ABC transporter related  94.62 
 
 		 316 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4023  ABC transporter related  94.3 
 
 		 316 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  67.43 
 
 		 304 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  66.78 
 
 		 304 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  68.98 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  68.3 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  68.3 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  67 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  67 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  64.97 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  62.14 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  56.01 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.82 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.03 
 
 		 259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.83 
 
 		 259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  51.03 
 
 		 259 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.88 
 
 		 252 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  51.26 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  54.42 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  53.33 
 
 		 258 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.17 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.62 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.22 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.97 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.2 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50.2 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  54.3 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  52.42 
 
 		 252 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.37 
 
 		 258 aa  245  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.09 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  48.52 
 
 		 254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.35 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.61 
 
 		 271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  49.38 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.66 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.41 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.84 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.69 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  49.6 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.15 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.21 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.1 
 
 		 254 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.58 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.4 
 
 		 283 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.57 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.92 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.16 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  49.37 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  49.36 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.02 
 
 		 253 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.78 
 
 		 263 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  48.77 
 
 		 289 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  49.6 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  51.07 
 
 		 295 aa  235  6e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.85 
 
 		 260 aa  235  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.01 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.68 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.36 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.62 
 
 		 264 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.95 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.95 
 
 		 293 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.47 
 
 		 274 aa  232  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  45.88 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.18 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 278 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.81 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.79 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.86 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.85 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  51.5 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  52.29 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.41 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  44.57 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.61 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.72 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.28 
 
 		 263 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 		 260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.96 
 
 		 267 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.11 
 
 		 246 aa  225  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  48.55 
 
 		 267 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.2 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  51.34 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  47.89 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.66 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.05 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.2 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  49.55 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>