More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4186 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.88 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.36 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  52.38 
 
 		 259 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.8 
 
 		 284 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.14 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.79 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.53 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.44 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.68 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.28 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.97 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.81 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  47.66 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.37 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.63 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.29 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  48.08 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  53.85 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  52.84 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  45.11 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.35 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  51.32 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.75 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.78 
 
 		 304 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.25 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.61 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.43 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.97 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.63 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.88 
 
 		 264 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  43.7 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.38 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.68 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  45.63 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.83 
 
 		 280 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  46.56 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.37 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.08 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.45 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.45 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.75 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.44 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.57 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.99 
 
 		 668 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.7 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.14 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.06 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.72 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.18 
 
 		 663 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.88 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.03 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  45.63 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  48.8 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.91 
 
 		 289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 265 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.28 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.66 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1254  ABC transporter related  51.93 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00814045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  43.41 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.08 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  42.22 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.14 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  48.82 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.49 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  52.34 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  43.75 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  43.75 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.27 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  42.8 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2596  ABC transporter, ATPase subunit  51.07 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  43.41 
 
 		 265 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  51.74 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.22 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.23 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  45.14 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.48 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.89 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  41.79 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>