More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2105 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  100 
 
 
289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.2 
 
 
274 aa  295  7e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.81 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.04 
 
 
288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.93 
 
 
286 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.38 
 
 
278 aa  280  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.62 
 
 
285 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.62 
 
 
285 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.27 
 
 
280 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.27 
 
 
280 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.24 
 
 
275 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.42 
 
 
278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  52.34 
 
 
277 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.94 
 
 
668 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.97 
 
 
337 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  56.34 
 
 
669 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  56.34 
 
 
669 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.72 
 
 
668 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.72 
 
 
668 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.73 
 
 
667 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.64 
 
 
267 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  56.13 
 
 
263 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.03 
 
 
257 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.23 
 
 
266 aa  261  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0642  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.63 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.24 
 
 
304 aa  261  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.64 
 
 
267 aa  261  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.72 
 
 
267 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  53.74 
 
 
659 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  51.84 
 
 
270 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  55.81 
 
 
668 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  56.81 
 
 
663 aa  259  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.49 
 
 
669 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.99 
 
 
673 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  56.07 
 
 
657 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.38 
 
 
295 aa  258  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.63 
 
 
267 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.42 
 
 
274 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.84 
 
 
269 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.81 
 
 
267 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.27 
 
 
278 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.42 
 
 
274 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.18 
 
 
284 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0379  putative nitrate ATP-binding ABC transporter protein  49.64 
 
 
268 aa  255  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.95656 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  47.88 
 
 
278 aa  255  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.63 
 
 
267 aa  255  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.84 
 
 
268 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 
278 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.3 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.3 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.84 
 
 
271 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.61 
 
 
265 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.06 
 
 
264 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.41 
 
 
274 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.72 
 
 
290 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.59 
 
 
282 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.64 
 
 
268 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3974  ABC transporter related  43.48 
 
 
292 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0320166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  50.62 
 
 
266 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.18 
 
 
286 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.55 
 
 
264 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.5 
 
 
263 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.37 
 
 
264 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1543  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.37 
 
 
264 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.42 
 
 
254 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2820  nitrate transport protein  46.35 
 
 
263 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.48 
 
 
287 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.58 
 
 
254 aa  245  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2495  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.39 
 
 
264 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.52 
 
 
262 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.52 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.66 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.89 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1440  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.01 
 
 
264 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5895  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  48.63 
 
 
267 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6459  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.22 
 
 
265 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2204  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.04 
 
 
288 aa  242  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.46 
 
 
297 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.43 
 
 
266 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.83 
 
 
265 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
290 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.38 
 
 
265 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2170  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.08 
 
 
308 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0468857  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  50.93 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2502  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.89 
 
 
264 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541276  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  53.02 
 
 
263 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.16 
 
 
251 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
276 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1705  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.02 
 
 
263 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
292 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.91 
 
 
264 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1966  ABC type nitrate transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
284 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.7754  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.76 
 
 
271 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.48 
 
 
273 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.79 
 
 
303 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  48.16 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50.83 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  49.23 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.17 
 
 
306 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>