More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2375 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  87.22 
 
 
267 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  86.84 
 
 
267 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2145  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  86.3 
 
 
270 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  82.26 
 
 
270 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  80.97 
 
 
269 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  79.47 
 
 
271 aa  434  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  79.23 
 
 
290 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  75.82 
 
 
274 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  76.14 
 
 
266 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0379  putative nitrate ATP-binding ABC transporter protein  74.16 
 
 
268 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.95656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  75 
 
 
267 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  74.23 
 
 
267 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  75 
 
 
267 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  72.62 
 
 
266 aa  394  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  73.85 
 
 
267 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  72.37 
 
 
263 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  69.14 
 
 
278 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  69.7 
 
 
265 aa  381  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  66.92 
 
 
268 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  66.67 
 
 
262 aa  357  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  65.48 
 
 
278 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  65.86 
 
 
278 aa  346  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2495  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  64.2 
 
 
264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481229  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6459  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.17 
 
 
265 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.17 
 
 
265 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1440  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.69 
 
 
264 aa  341  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.79 
 
 
282 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.79 
 
 
264 aa  338  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1543  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.79 
 
 
264 aa  337  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  59.85 
 
 
292 aa  336  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1705  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  60.08 
 
 
263 aa  333  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  61.63 
 
 
286 aa  332  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  61.72 
 
 
262 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  61.3 
 
 
295 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5895  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  59.93 
 
 
267 aa  327  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2820  nitrate transport protein  58.62 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  59 
 
 
265 aa  325  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  57.03 
 
 
264 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2502  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  58.62 
 
 
264 aa  322  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541276  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  59 
 
 
264 aa  321  6e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  60.54 
 
 
284 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  63.56 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.6 
 
 
264 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  55.68 
 
 
266 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  64.26 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  64.26 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.88 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.88 
 
 
280 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  53.82 
 
 
277 aa  299  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.49 
 
 
280 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  52.67 
 
 
274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.11 
 
 
286 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.31 
 
 
337 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.58 
 
 
285 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.58 
 
 
285 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.87 
 
 
669 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.73 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.97 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  55.17 
 
 
668 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.94 
 
 
668 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.94 
 
 
668 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.75 
 
 
663 aa  278  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.3 
 
 
278 aa  277  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  55.56 
 
 
657 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.81 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.81 
 
 
278 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.39 
 
 
257 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  53.99 
 
 
667 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.85 
 
 
669 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.87 
 
 
673 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.85 
 
 
669 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.47 
 
 
659 aa  271  7e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.54 
 
 
668 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5413  putative nitrate ABC transporter ATP-binding protein (ntrC/D-like protein)  50.78 
 
 
300 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.42 
 
 
290 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
301 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
326 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
326 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50 
 
 
557 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0642  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.41 
 
 
281 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4816  ABC transporter related  49.62 
 
 
311 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  hitchhiker  0.00101166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2204  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.26 
 
 
288 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.23 
 
 
287 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  46.54 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2170  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.67 
 
 
308 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0468857  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.57 
 
 
276 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1665  ABC transporter  48.82 
 
 
561 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0690908  normal  0.0741534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  49.03 
 
 
587 aa  255  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.21 
 
 
573 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  51.84 
 
 
289 aa  255  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2056  ABC transporter related  47.49 
 
 
305 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2619  ABC transporter related  47.31 
 
 
308 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53368  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.39 
 
 
274 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2405  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.06 
 
 
295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.01 
 
 
263 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
274 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3974  ABC transporter related  49.8 
 
 
292 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0320166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1966  ABC type nitrate transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
284 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.7754  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0290  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.13 
 
 
291 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>