More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1025 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  73.98 
 
 
673 aa  1055    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  59.17 
 
 
668 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  100 
 
 
667 aa  1379    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  60.06 
 
 
657 aa  805    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  62.2 
 
 
668 aa  853    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  73.22 
 
 
669 aa  1036    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  71.43 
 
 
663 aa  1003    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  76.83 
 
 
668 aa  1086    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  59.7 
 
 
669 aa  822    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  59.17 
 
 
668 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  73.22 
 
 
669 aa  1036    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.09 
 
 
659 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  56.57 
 
 
277 aa  308  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  55.78 
 
 
288 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  56.82 
 
 
263 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  56.57 
 
 
275 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  55.06 
 
 
266 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  55.29 
 
 
278 aa  293  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.19 
 
 
280 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.19 
 
 
280 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.18 
 
 
278 aa  293  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.78 
 
 
280 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.14 
 
 
269 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  55.34 
 
 
274 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.58 
 
 
274 aa  292  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  55.34 
 
 
274 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.55 
 
 
337 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.78 
 
 
286 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.46 
 
 
266 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  55.81 
 
 
268 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.2 
 
 
285 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0642  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.75 
 
 
281 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.2 
 
 
285 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.28 
 
 
257 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.41 
 
 
271 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 
292 aa  285  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.41 
 
 
270 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.17 
 
 
265 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.51 
 
 
262 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.51 
 
 
265 aa  282  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
278 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  53.78 
 
 
278 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  53.08 
 
 
267 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2502  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.85 
 
 
264 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541276  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  53.64 
 
 
267 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.31 
 
 
284 aa  277  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  52.99 
 
 
295 aa  276  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.92 
 
 
264 aa  276  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  52.79 
 
 
274 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5895  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  54.62 
 
 
267 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.98 
 
 
264 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.98 
 
 
264 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  53.73 
 
 
266 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.08 
 
 
263 aa  275  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  57.14 
 
 
264 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2820  nitrate transport protein  53.31 
 
 
263 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.78 
 
 
286 aa  274  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6459  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.85 
 
 
265 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  52.76 
 
 
587 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  38.54 
 
 
467 aa  272  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  52.31 
 
 
264 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.99 
 
 
268 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.64 
 
 
267 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.75 
 
 
267 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.14 
 
 
267 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  57.58 
 
 
264 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.64 
 
 
267 aa  270  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.08 
 
 
265 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0379  putative nitrate ATP-binding ABC transporter protein  51.75 
 
 
268 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.95656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.39 
 
 
262 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2145  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.58 
 
 
270 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.6 
 
 
290 aa  267  4e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1082  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.34 
 
 
573 aa  267  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1966  ABC type nitrate transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
284 aa  266  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.7754  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.61 
 
 
304 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2495  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.61 
 
 
264 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0481229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1665  ABC transporter  50.19 
 
 
561 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0690908  normal  0.0741534 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  53.28 
 
 
282 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.73 
 
 
289 aa  264  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.22 
 
 
264 aa  264  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.43 
 
 
557 aa  263  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1440  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.61 
 
 
264 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.42 
 
 
326 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.78 
 
 
290 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.42 
 
 
301 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1543  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.83 
 
 
264 aa  262  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.03 
 
 
326 aa  260  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4816  ABC transporter related  49.03 
 
 
311 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  hitchhiker  0.00101166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.19 
 
 
278 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1705  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.8 
 
 
263 aa  257  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2405  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.61 
 
 
295 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2170  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.09 
 
 
308 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0468857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2619  ABC transporter related  45.7 
 
 
308 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53368  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.45 
 
 
276 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5413  putative nitrate ABC transporter ATP-binding protein (ntrC/D-like protein)  44.41 
 
 
300 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2204  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.22 
 
 
288 aa  250  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  46.22 
 
 
308 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.19 
 
 
287 aa  247  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2056  ABC transporter related  46.12 
 
 
305 aa  247  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0290  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.89 
 
 
291 aa  239  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>