More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0392 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  96.06 
 
 
254 aa  500  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  94.49 
 
 
254 aa  494  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  81.5 
 
 
254 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  73.41 
 
 
258 aa  388  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  57.83 
 
 
251 aa  316  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  57.89 
 
 
252 aa  298  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  56.38 
 
 
253 aa  296  3e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  54.92 
 
 
263 aa  291  9e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 
254 aa  287  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  55.36 
 
 
261 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  55.14 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  53.17 
 
 
259 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  56.6 
 
 
297 aa  285  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.82 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  55.7 
 
 
267 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  53.15 
 
 
259 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  54.66 
 
 
278 aa  279  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  51.67 
 
 
252 aa  278  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.2 
 
 
280 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.57 
 
 
259 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  53.56 
 
 
264 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  54.17 
 
 
267 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.78 
 
 
259 aa  275  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.78 
 
 
259 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  52.52 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  51.67 
 
 
260 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  49.41 
 
 
261 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  50.2 
 
 
253 aa  269  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  53.95 
 
 
259 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  49.6 
 
 
253 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  50.41 
 
 
304 aa  265  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.23 
 
 
272 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.8 
 
 
272 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.21 
 
 
267 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50.83 
 
 
304 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  53.1 
 
 
276 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  51.03 
 
 
246 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  53.16 
 
 
278 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  50.41 
 
 
256 aa  262  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.93 
 
 
288 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
261 aa  261  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
308 aa  261  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50 
 
 
304 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  50.59 
 
 
301 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50 
 
 
283 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.03 
 
 
286 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.42 
 
 
272 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  53.04 
 
 
269 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.41 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.46 
 
 
292 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  51 
 
 
257 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.65 
 
 
263 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  48.03 
 
 
257 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.76 
 
 
303 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.2 
 
 
259 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
256 aa  255  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.84 
 
 
273 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.76 
 
 
303 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.22 
 
 
261 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.76 
 
 
303 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.83 
 
 
255 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  51.52 
 
 
267 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.91 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  52.97 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.85 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
264 aa  252  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  48.79 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50.62 
 
 
267 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
272 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50 
 
 
291 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.27 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  51.52 
 
 
267 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 
272 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.76 
 
 
283 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  57.08 
 
 
261 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
278 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.65 
 
 
293 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  51.08 
 
 
289 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.65 
 
 
287 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 
281 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.65 
 
 
293 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  49.16 
 
 
272 aa  248  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  48.56 
 
 
249 aa  248  7e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.37 
 
 
259 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.21 
 
 
279 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50 
 
 
289 aa  247  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 
273 aa  247  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  52.14 
 
 
268 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.83 
 
 
284 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
260 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  46.48 
 
 
262 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
271 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  45.53 
 
 
273 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  49.6 
 
 
275 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 
281 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>