More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0327 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  74.4 
 
 		 267 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  70.43 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  72.16 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  70.38 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  73.52 
 
 		 259 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  70.5 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  69.77 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  70 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  70.47 
 
 		 259 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  66.92 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  62.5 
 
 		 274 aa  302  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  53.56 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  53.56 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  52.72 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  54.17 
 
 		 253 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.64 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.8 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  53.91 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  50.21 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  48.25 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  54.15 
 
 		 257 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.6 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  50.19 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  50.58 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.8 
 
 		 267 aa  258  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 264 aa  254  9e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  47.84 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 		 254 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  53.85 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.57 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  51.78 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.21 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.82 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.61 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  52.97 
 
 		 286 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  52 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  50.99 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  48.81 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.39 
 
 		 267 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  54.98 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.77 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  54.98 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  54.98 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.39 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.17 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  53.06 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.21 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  48 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  55.41 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.6 
 
 		 284 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  54.03 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  50.85 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.2 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  54.24 
 
 		 293 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  48.79 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  53.81 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50.6 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  52.91 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  51.06 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.59 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  49.6 
 
 		 263 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.91 
 
 		 304 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.83 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.54 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  53.81 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  48.46 
 
 		 284 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  51.54 
 
 		 279 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.54 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  46.75 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.78 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  50.79 
 
 		 298 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  51.2 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  53.6 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.4 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  52.65 
 
 		 281 aa  235  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  49.61 
 
 		 285 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.2 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.2 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.68 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 252 aa  235  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 251 aa  235  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50 
 
 		 288 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.98 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  52.47 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.68 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>