More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1956 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  99.26 
 
 
272 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  99.63 
 
 
272 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  67.05 
 
 
267 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  67.31 
 
 
267 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  68.87 
 
 
287 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  67.7 
 
 
293 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  67.7 
 
 
293 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  66.93 
 
 
263 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  67.19 
 
 
289 aa  359  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  66.01 
 
 
271 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  65.61 
 
 
271 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  63.22 
 
 
271 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  64.06 
 
 
272 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 
253 aa  269  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.1 
 
 
272 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  265  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.84 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.98 
 
 
258 aa  264  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50 
 
 
252 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50.42 
 
 
272 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.4 
 
 
261 aa  260  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48 
 
 
252 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
256 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  50.2 
 
 
297 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.79 
 
 
259 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.88 
 
 
263 aa  256  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.58 
 
 
260 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.39 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.79 
 
 
258 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.16 
 
 
254 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.22 
 
 
260 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.34 
 
 
280 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.57 
 
 
257 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45 
 
 
291 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.16 
 
 
254 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.13 
 
 
263 aa  248  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 
260 aa  248  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  48.74 
 
 
254 aa  248  8e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50 
 
 
292 aa  248  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 
264 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.56 
 
 
274 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
254 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.08 
 
 
258 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  51.11 
 
 
257 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.22 
 
 
264 aa  244  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.98 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.29 
 
 
261 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.34 
 
 
283 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  48.31 
 
 
301 aa  243  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.84 
 
 
267 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.99 
 
 
278 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.22 
 
 
274 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.66 
 
 
256 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
267 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 
256 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
260 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.62 
 
 
279 aa  238  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.91 
 
 
273 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.69 
 
 
264 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.54 
 
 
267 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.22 
 
 
255 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.4 
 
 
282 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.37 
 
 
257 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.12 
 
 
284 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  48.68 
 
 
264 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.75 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.56 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.34 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.56 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.56 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.09 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.28 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.97 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.83 
 
 
259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  48.79 
 
 
271 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 
259 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.11 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.99 
 
 
278 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.71 
 
 
306 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  42.8 
 
 
276 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  41.89 
 
 
271 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
265 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.74 
 
 
271 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.69 
 
 
278 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 
260 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 
259 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
311 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
308 aa  228  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.2 
 
 
269 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.01 
 
 
266 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.9 
 
 
259 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
281 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>