More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5225 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  100 
 
 
304 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  96.38 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  86.18 
 
 
303 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  86.18 
 
 
303 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  86.18 
 
 
303 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  74.16 
 
 
304 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  72.58 
 
 
307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  74.16 
 
 
306 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  72.88 
 
 
308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  67.43 
 
 
315 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3728  ABC transporter related  68.52 
 
 
316 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.365004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4023  ABC transporter related  68.2 
 
 
316 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  58.42 
 
 
303 aa  360  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  56.1 
 
 
253 aa  286  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  55.37 
 
 
259 aa  278  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
261 aa  276  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.19 
 
 
253 aa  275  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  55.19 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  52.4 
 
 
261 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  55.79 
 
 
259 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  53.44 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  52.78 
 
 
286 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  54.73 
 
 
259 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  54.2 
 
 
283 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  54.55 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 
259 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.37 
 
 
258 aa  268  8e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  51.24 
 
 
254 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 
254 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  55.22 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.83 
 
 
254 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.58 
 
 
254 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 
252 aa  264  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  54.32 
 
 
261 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  51.79 
 
 
278 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.83 
 
 
254 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  53.25 
 
 
272 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  52.23 
 
 
259 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.82 
 
 
291 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  51.37 
 
 
257 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.42 
 
 
260 aa  258  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  52.97 
 
 
272 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  53.72 
 
 
259 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.75 
 
 
253 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  53.45 
 
 
258 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  50.4 
 
 
257 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  56.39 
 
 
274 aa  255  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.8 
 
 
252 aa  255  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  52.85 
 
 
283 aa  254  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.47 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.86 
 
 
260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.59 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  52.44 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51.03 
 
 
267 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.03 
 
 
293 aa  251  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  51.2 
 
 
267 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.59 
 
 
263 aa  249  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50 
 
 
267 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  48.39 
 
 
276 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  52.34 
 
 
264 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.13 
 
 
286 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  52.79 
 
 
267 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
267 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.18 
 
 
246 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
260 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.41 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  51.87 
 
 
249 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  46.92 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.02 
 
 
285 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.87 
 
 
282 aa  242  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
260 aa  242  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.83 
 
 
284 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50.62 
 
 
292 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  48.74 
 
 
271 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.92 
 
 
269 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  53.36 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  49.59 
 
 
292 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.34 
 
 
288 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 
281 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  53.36 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  53.36 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  53.36 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
265 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.5 
 
 
256 aa  239  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  52.91 
 
 
264 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.43 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.18 
 
 
259 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.83 
 
 
266 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.7 
 
 
269 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.91 
 
 
279 aa  238  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.18 
 
 
263 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  48.12 
 
 
265 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
261 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.53 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
265 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.77 
 
 
271 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  46.47 
 
 
271 aa  235  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>