More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1030 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  64.54 
 
 
252 aa  342  5e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  61.45 
 
 
253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  59.6 
 
 
251 aa  324  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  59.92 
 
 
253 aa  310  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  58.47 
 
 
263 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  55.87 
 
 
258 aa  298  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  57.72 
 
 
260 aa  295  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  55.6 
 
 
254 aa  294  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  56.97 
 
 
254 aa  292  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  56.18 
 
 
254 aa  292  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  56.18 
 
 
254 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  57.55 
 
 
246 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  55.47 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.19 
 
 
259 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  54.92 
 
 
274 aa  275  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  51.95 
 
 
288 aa  273  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  53.74 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  54.63 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  54.85 
 
 
259 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  53.39 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
261 aa  269  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  52.34 
 
 
297 aa  268  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51 
 
 
269 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  52.44 
 
 
259 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  57.99 
 
 
260 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  54.42 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  56.94 
 
 
307 aa  264  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  54.42 
 
 
303 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  54.42 
 
 
303 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
261 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.81 
 
 
267 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.77 
 
 
304 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  50.6 
 
 
259 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  51 
 
 
259 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  51.59 
 
 
263 aa  262  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.67 
 
 
258 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  53.98 
 
 
303 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  52.74 
 
 
259 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 
259 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  54.19 
 
 
264 aa  261  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
278 aa  261  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51 
 
 
267 aa  261  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  58.49 
 
 
280 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  52.05 
 
 
272 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  51 
 
 
261 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  52.61 
 
 
264 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.07 
 
 
272 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.8 
 
 
271 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  49.2 
 
 
271 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  49.8 
 
 
262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.8 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  54.19 
 
 
283 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
278 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  51 
 
 
260 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
308 aa  258  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  52.04 
 
 
265 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  52.21 
 
 
269 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 
259 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.25 
 
 
283 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50.4 
 
 
267 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 
264 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  51.61 
 
 
264 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
256 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.79 
 
 
272 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  51.45 
 
 
256 aa  255  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 
260 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.4 
 
 
264 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.81 
 
 
259 aa  254  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  49.2 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  49.39 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  50 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.21 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  54.81 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.2 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.39 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.41 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.01 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.01 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 
272 aa  251  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.22 
 
 
267 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.41 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 
272 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.5 
 
 
292 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
260 aa  251  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 
281 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.22 
 
 
287 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 
251 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  52.38 
 
 
285 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.62 
 
 
253 aa  250  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.8 
 
 
267 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  49.8 
 
 
267 aa  250  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.81 
 
 
286 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.22 
 
 
273 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  48.68 
 
 
273 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.39 
 
 
268 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  50.65 
 
 
289 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.2 
 
 
257 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 
255 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>