More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0849 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  100 
 
 
253 aa  516  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  67.61 
 
 
263 aa  345  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  61.29 
 
 
252 aa  330  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  62.8 
 
 
252 aa  330  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  60.98 
 
 
253 aa  329  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  63.97 
 
 
260 aa  328  7e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  62.98 
 
 
254 aa  325  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  60.25 
 
 
251 aa  311  4.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  54.32 
 
 
258 aa  298  7e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  54.73 
 
 
254 aa  298  7e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  56.38 
 
 
254 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  56.33 
 
 
254 aa  295  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  55.69 
 
 
254 aa  295  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  51.63 
 
 
261 aa  281  8.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  52.67 
 
 
246 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  52.08 
 
 
264 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  53.66 
 
 
304 aa  275  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  52.19 
 
 
304 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.69 
 
 
304 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  56.33 
 
 
274 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  53.25 
 
 
308 aa  273  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  56.19 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  54.29 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  52.65 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  52.38 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  56.6 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  51.84 
 
 
259 aa  272  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  54.94 
 
 
297 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  52 
 
 
261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.03 
 
 
258 aa  271  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  51.67 
 
 
256 aa  271  6e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  52.63 
 
 
272 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  55.19 
 
 
272 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  52.46 
 
 
306 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  51.44 
 
 
265 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  55.56 
 
 
307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  52.21 
 
 
271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  51.21 
 
 
272 aa  269  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
272 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.16 
 
 
288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  54.39 
 
 
272 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  51.21 
 
 
272 aa  268  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.61 
 
 
259 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
271 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 
271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  52.85 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  52.8 
 
 
269 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.41 
 
 
261 aa  264  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  52.82 
 
 
315 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  53.85 
 
 
259 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  50.2 
 
 
263 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  51.21 
 
 
303 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  51.21 
 
 
303 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  51.21 
 
 
303 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.79 
 
 
253 aa  261  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.85 
 
 
274 aa  261  6.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  52.17 
 
 
303 aa  260  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  53.01 
 
 
287 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  49.17 
 
 
260 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51.01 
 
 
267 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  52.74 
 
 
259 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 
264 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  50.41 
 
 
273 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  48.77 
 
 
262 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.4 
 
 
293 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.4 
 
 
293 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  53.51 
 
 
254 aa  258  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  55.16 
 
 
260 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  51.61 
 
 
284 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  52.42 
 
 
267 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.86 
 
 
292 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
259 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
267 aa  255  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  53.74 
 
 
267 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.4 
 
 
271 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  48.03 
 
 
301 aa  255  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  51.33 
 
 
279 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  52.42 
 
 
267 aa  254  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  58.96 
 
 
280 aa  254  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.8 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  49.8 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  47.54 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  54.79 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  53.1 
 
 
284 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  54.22 
 
 
289 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  51.71 
 
 
256 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.67 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  51.57 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
251 aa  251  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  52.68 
 
 
255 aa  251  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  52.85 
 
 
267 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
278 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.2 
 
 
264 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.45 
 
 
264 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  52.85 
 
 
293 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.44 
 
 
293 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
258 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>