More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0209 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  89.82 
 
 		 285 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  74.2 
 
 		 282 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  63.3 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  63.3 
 
 		 293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  63.28 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  63.77 
 
 		 283 aa  324  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  65.34 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  65.6 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  65.6 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  64.66 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  50.97 
 
 		 286 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.69 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  52.33 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.36 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  52.19 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  51.43 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  54.08 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  52.34 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.38 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.7 
 
 		 258 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  49.8 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  51.79 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  53.47 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.76 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.88 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.76 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  53.31 
 
 		 307 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 264 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  52.4 
 
 		 303 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  55.17 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  55.17 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.76 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  53.25 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  51.28 
 
 		 261 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  53.68 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.72 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  52.81 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  50.42 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  51.05 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.43 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  50.59 
 
 		 263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.83 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  51.59 
 
 		 268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 267 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  52.79 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.79 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.69 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.63 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 		 265 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  42.86 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  50.4 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.28 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 264 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  49.8 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  51.74 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.98 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  49.8 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  49.8 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  50 
 
 		 265 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 260 aa  235  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.41 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.31 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.73 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.59 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  49.59 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.79 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.79 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.15 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  49.38 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  47.64 
 
 		 262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  51.05 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.79 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  52.16 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.95 
 
 		 258 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  50.98 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  48.12 
 
 		 259 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  52.59 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.68 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.73 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.18 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.64 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  50.83 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  52.12 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.06 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>