More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1976 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  98.09 
 
 
262 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  96.03 
 
 
262 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.6 
 
 
283 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  64 
 
 
285 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  62.16 
 
 
282 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.11 
 
 
265 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  63.05 
 
 
293 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  62.65 
 
 
293 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  63.16 
 
 
283 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.42 
 
 
279 aa  268  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  50.19 
 
 
286 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  56.71 
 
 
264 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50 
 
 
291 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.19 
 
 
283 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.42 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  54.98 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  53.36 
 
 
304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.6 
 
 
274 aa  251  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  49.81 
 
 
267 aa  251  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  53.88 
 
 
303 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  53.78 
 
 
303 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  54.73 
 
 
304 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  53.88 
 
 
303 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
261 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  53.74 
 
 
253 aa  248  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  51.32 
 
 
245 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.03 
 
 
267 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  51.69 
 
 
278 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.91 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  56.52 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  55.35 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.21 
 
 
306 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  51.37 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.86 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  52.68 
 
 
255 aa  241  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.62 
 
 
307 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.22 
 
 
258 aa  239  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  47.84 
 
 
292 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.2 
 
 
263 aa  237  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.64 
 
 
252 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  52.38 
 
 
251 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
308 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50 
 
 
261 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  54.11 
 
 
258 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.98 
 
 
263 aa  234  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  49.15 
 
 
260 aa  234  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  50.59 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.18 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.57 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.35 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.26 
 
 
254 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  51.32 
 
 
259 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  49.14 
 
 
262 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.9 
 
 
254 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.44 
 
 
260 aa  232  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  43.18 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  51.06 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.9 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.77 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.18 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.49 
 
 
254 aa  231  9e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  53.68 
 
 
261 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
256 aa  230  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  52.63 
 
 
264 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.78 
 
 
259 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  50 
 
 
259 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
261 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50.21 
 
 
292 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.59 
 
 
260 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
278 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.79 
 
 
259 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  52.36 
 
 
287 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  52.16 
 
 
263 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.86 
 
 
267 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.61 
 
 
253 aa  227  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  52.36 
 
 
293 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  52.36 
 
 
293 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
265 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.5 
 
 
284 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  49.54 
 
 
257 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.65 
 
 
264 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.54 
 
 
259 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
278 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.29 
 
 
280 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  45.27 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.34 
 
 
267 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 
271 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  49.15 
 
 
259 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  50.22 
 
 
263 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
272 aa  225  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  46.56 
 
 
272 aa  224  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
264 aa  224  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
271 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  53.39 
 
 
271 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.15 
 
 
273 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>