More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3352 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  61.85 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  61.07 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  60.08 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.5 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  58.89 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  56.85 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  58.43 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 284 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  58.04 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  57.03 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  60.85 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  56.63 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  56.63 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.83 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  55.33 
 
 		 259 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  58.61 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  53.88 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  55.33 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  56.15 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 		 279 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  55.23 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  54.55 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  56.3 
 
 		 269 aa  271  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  57.59 
 
 		 266 aa  268  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  53.28 
 
 		 271 aa  261  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.18 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  57.27 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  53.09 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  54.62 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  51.27 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  54.32 
 
 		 263 aa  251  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  55.65 
 
 		 261 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.68 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 267 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  48.81 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.86 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.86 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.86 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  50.43 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 		 259 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.44 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50.82 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  47.01 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.08 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  47.01 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  47.29 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.93 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.11 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.77 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  50.21 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.15 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.43 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  44.96 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  49.56 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.57 
 
 		 274 aa  235  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  49.59 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50.22 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.49 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.15 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.56 
 
 		 260 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.39 
 
 		 259 aa  234  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 308 aa  234  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.52 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.15 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.49 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.08 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  48.35 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.06 
 
 		 307 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50.44 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  45.27 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  47.58 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  47.3 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.61 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  49.59 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.88 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.05 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  47.26 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.44 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.93 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>