More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5606 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  100 
 
 
264 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  50.19 
 
 
259 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  50.79 
 
 
259 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.58 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  49.81 
 
 
260 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.81 
 
 
259 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  53.74 
 
 
251 aa  263  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  53.94 
 
 
273 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  55.11 
 
 
263 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  55.79 
 
 
269 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  52.28 
 
 
258 aa  261  8e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  56.6 
 
 
275 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.6 
 
 
261 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.2 
 
 
291 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  50.65 
 
 
254 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.59 
 
 
252 aa  257  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  51 
 
 
267 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  53.74 
 
 
258 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  255  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
278 aa  255  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  52.59 
 
 
264 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.62 
 
 
259 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.21 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.6 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  52.11 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  52.9 
 
 
295 aa  251  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.45 
 
 
253 aa  250  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 
264 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.98 
 
 
264 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.6 
 
 
253 aa  250  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.39 
 
 
288 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.97 
 
 
261 aa  248  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  53.17 
 
 
264 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
261 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.55 
 
 
286 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  57.33 
 
 
272 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  51.81 
 
 
290 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.13 
 
 
286 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
261 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  53.78 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.92 
 
 
263 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  50.2 
 
 
270 aa  245  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  48 
 
 
267 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.97 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.22 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  49 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  52.21 
 
 
260 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  50.19 
 
 
276 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  51.38 
 
 
276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.08 
 
 
260 aa  242  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48 
 
 
267 aa  241  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  52.07 
 
 
271 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.1 
 
 
281 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  49.79 
 
 
278 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  53.98 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.65 
 
 
292 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  47.73 
 
 
301 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.61 
 
 
282 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.42 
 
 
253 aa  240  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  50.2 
 
 
259 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.85 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.78 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  52.07 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50.2 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.15 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.85 
 
 
280 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.78 
 
 
306 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  53.74 
 
 
257 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.81 
 
 
258 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.74 
 
 
263 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.03 
 
 
283 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.07 
 
 
271 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  47.66 
 
 
257 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.78 
 
 
307 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
272 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.69 
 
 
272 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  48.57 
 
 
315 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50.81 
 
 
267 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
272 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  49.01 
 
 
284 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  51.28 
 
 
272 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  51.57 
 
 
297 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.82 
 
 
267 aa  235  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.56 
 
 
267 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.2 
 
 
268 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.15 
 
 
285 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.15 
 
 
285 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.97 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  50.9 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.18 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.19 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.56 
 
 
280 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  49.37 
 
 
259 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.77 
 
 
303 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>