More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1421 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  98.98 
 
 
293 aa  587  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  88.74 
 
 
287 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  82.59 
 
 
289 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  72.48 
 
 
263 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  71.92 
 
 
271 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  71.92 
 
 
271 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  71.15 
 
 
271 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  70.88 
 
 
267 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  67.7 
 
 
272 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  67.7 
 
 
272 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  67.7 
 
 
272 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  69.35 
 
 
267 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  69.23 
 
 
272 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  55.14 
 
 
272 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  52.67 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  52.81 
 
 
283 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 
253 aa  258  7e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.81 
 
 
260 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49 
 
 
252 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.64 
 
 
251 aa  256  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  51.67 
 
 
260 aa  256  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  51.78 
 
 
259 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.13 
 
 
258 aa  255  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.56 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  51.45 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
261 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.99 
 
 
291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  50.6 
 
 
259 aa  252  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 
264 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.85 
 
 
254 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  49 
 
 
261 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.21 
 
 
306 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.65 
 
 
254 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.57 
 
 
297 aa  248  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  51.12 
 
 
254 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.64 
 
 
279 aa  248  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  51.12 
 
 
254 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.88 
 
 
274 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.5 
 
 
292 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.42 
 
 
269 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.71 
 
 
274 aa  245  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.84 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.8 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.34 
 
 
253 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50.62 
 
 
303 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.81 
 
 
259 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.8 
 
 
303 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.8 
 
 
303 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.21 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.15 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
308 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 
256 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  51.02 
 
 
311 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  52.36 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
273 aa  241  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.83 
 
 
260 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.33 
 
 
280 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.79 
 
 
286 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.83 
 
 
304 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
267 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 
261 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 
278 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.06 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
261 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.78 
 
 
257 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  49.78 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.79 
 
 
259 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
278 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.78 
 
 
263 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.72 
 
 
263 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.31 
 
 
258 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.4 
 
 
259 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  44.68 
 
 
303 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.2 
 
 
264 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.61 
 
 
267 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.39 
 
 
259 aa  234  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.79 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.85 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.77 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.15 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  49.58 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  51.26 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.74 
 
 
304 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.77 
 
 
257 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  47.95 
 
 
315 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  48.48 
 
 
263 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.79 
 
 
258 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.36 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.99 
 
 
257 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  46.83 
 
 
259 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.8 
 
 
260 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.11 
 
 
265 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
290 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.56 
 
 
669 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>