More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1691 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  75.75 
 
 		 278 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  73.33 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  68.86 
 
 		 267 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  64.93 
 
 		 292 aa  349  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  66.17 
 
 		 273 aa  347  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  65.02 
 
 		 278 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  60.24 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  56.51 
 
 		 295 aa  298  6e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  59.66 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  57.81 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  55.79 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  52.12 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  55.94 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  53.06 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  54.2 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  52.24 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  58.74 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  51.76 
 
 		 264 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  51.2 
 
 		 252 aa  261  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  58.49 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  54.31 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  54.73 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.25 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  47.6 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  58.5 
 
 		 253 aa  257  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  54.39 
 
 		 263 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  57.49 
 
 		 263 aa  255  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  51.34 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  58.96 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  54.98 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  53.19 
 
 		 278 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  56.37 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 265 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  55 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  54.98 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  55.34 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  55.98 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  55.34 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  55.34 
 
 		 272 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  50.86 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.61 
 
 		 261 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.3 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.78 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.71 
 
 		 291 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.61 
 
 		 257 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.56 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.17 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  48.68 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  52.07 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.43 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50.77 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  52.16 
 
 		 263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  55.14 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  49.36 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  56.82 
 
 		 272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  56.3 
 
 		 267 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.19 
 
 		 262 aa  241  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  53.33 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  53.33 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  52.38 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.15 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.96 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  49.18 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  49.45 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  51.69 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.12 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.63 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  55.7 
 
 		 281 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.85 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.52 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  53.28 
 
 		 253 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  50.81 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  55.24 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  48.41 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.8 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.28 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  55.11 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.03 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  55.11 
 
 		 271 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  45.69 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  50.78 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.72 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>