More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0435 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  66.8 
 
 
256 aa  374  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  57.36 
 
 
263 aa  318  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.12 
 
 
258 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  53.31 
 
 
253 aa  280  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  51.43 
 
 
264 aa  277  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  53.31 
 
 
254 aa  277  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.67 
 
 
253 aa  271  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.82 
 
 
260 aa  266  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.21 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.85 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
265 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.75 
 
 
258 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.41 
 
 
254 aa  262  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.41 
 
 
254 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 
254 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.83 
 
 
297 aa  258  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  55.31 
 
 
284 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  51.65 
 
 
261 aa  257  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50.21 
 
 
259 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  49.6 
 
 
265 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.93 
 
 
274 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  51.08 
 
 
267 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.97 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.2 
 
 
259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.72 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.78 
 
 
267 aa  251  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
261 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.77 
 
 
252 aa  250  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.68 
 
 
281 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 
284 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  47.33 
 
 
298 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.54 
 
 
246 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 
254 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
264 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  45.68 
 
 
278 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.18 
 
 
267 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
255 aa  247  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
278 aa  245  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  47.43 
 
 
259 aa  245  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.68 
 
 
280 aa  244  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.94 
 
 
281 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
278 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  45.75 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  46.5 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  44.44 
 
 
257 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.11 
 
 
288 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  45.34 
 
 
281 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  45.34 
 
 
281 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  47.58 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  43.78 
 
 
285 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 
272 aa  241  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.9 
 
 
272 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.18 
 
 
273 aa  241  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.66 
 
 
272 aa  240  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.66 
 
 
272 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.05 
 
 
272 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.61 
 
 
301 aa  240  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.5 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.5 
 
 
304 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.92 
 
 
271 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.41 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 
271 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.37 
 
 
292 aa  238  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.78 
 
 
274 aa  237  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  42.69 
 
 
286 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.49 
 
 
286 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.49 
 
 
286 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  44.26 
 
 
260 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
267 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.7 
 
 
279 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  45 
 
 
281 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.27 
 
 
304 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.11 
 
 
253 aa  236  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
260 aa  236  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  45.08 
 
 
256 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.96 
 
 
280 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.75 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.86 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.32 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.18 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
258 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
260 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.77 
 
 
264 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  43.85 
 
 
259 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  44.81 
 
 
262 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.69 
 
 
259 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  43.57 
 
 
266 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.09 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.35 
 
 
291 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.14 
 
 
303 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.14 
 
 
303 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.14 
 
 
303 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  49.78 
 
 
263 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  44.67 
 
 
256 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  44.67 
 
 
256 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 
273 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  45.49 
 
 
264 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>