More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0079 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  100 
 
 		 307 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  73.24 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  72.58 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  71.29 
 
 		 304 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  70.13 
 
 		 303 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  69.81 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  69.81 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  69.67 
 
 		 306 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  69.59 
 
 		 308 aa  417  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  62.14 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3728  ABC transporter related  61.17 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.365004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4023  ABC transporter related  60.84 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  59.77 
 
 		 303 aa  350  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  55.7 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.67 
 
 		 252 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 261 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  51.42 
 
 		 259 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.8 
 
 		 259 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.82 
 
 		 260 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  51.82 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  53.54 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  56.94 
 
 		 254 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  52.46 
 
 		 259 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.83 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  52.05 
 
 		 259 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  55.11 
 
 		 253 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  50.61 
 
 		 286 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  55.11 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  49.59 
 
 		 283 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.07 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.41 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  54.22 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.19 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.44 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.2 
 
 		 258 aa  255  8e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  53.12 
 
 		 260 aa  254  9e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  49.79 
 
 		 272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  49.8 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.31 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.01 
 
 		 291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.45 
 
 		 274 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  49.59 
 
 		 253 aa  252  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.79 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  52.44 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.39 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.84 
 
 		 285 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.44 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.35 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  49.59 
 
 		 260 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  52.44 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  57.28 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  48.57 
 
 		 269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.05 
 
 		 258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  47.62 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.15 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.15 
 
 		 293 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.56 
 
 		 267 aa  242  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.09 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  51.22 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  48.05 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  51.63 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 		 264 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 260 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  47.15 
 
 		 285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.79 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  47.06 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.36 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.74 
 
 		 289 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.91 
 
 		 287 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 273 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.35 
 
 		 259 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  50.81 
 
 		 293 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.69 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.18 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  44.57 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.39 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.08 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  49.78 
 
 		 257 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.03 
 
 		 280 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.75 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.12 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  49.78 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.76 
 
 		 271 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 261 aa  235  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.72 
 
 		 276 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49 
 
 		 278 aa  235  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.15 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.32 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.19 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>