More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0039 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4886  ABC transporter related  73.9 
 
 		 282 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188443  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3789  ABC transporter related  72.06 
 
 		 281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.860108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  57.81 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  52.54 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.81 
 
 		 306 aa  241  7e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  49.79 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.28 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  49.78 
 
 		 307 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.17 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  48.96 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.96 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.96 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.15 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.32 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.18 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.69 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.67 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.78 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.32 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.06 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.47 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.88 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.6 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.69 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.6 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.66 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.41 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.32 
 
 		 267 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  48.54 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.49 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  49.01 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  47.67 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.31 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  44.27 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.64 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  48.18 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.33 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.32 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.32 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  47.97 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  44.84 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.14 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.96 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.67 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.98 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  42.86 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.87 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.83 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  48.98 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.28 
 
 		 276 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.77 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.01 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.77 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.35 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.16 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  48.95 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  48.41 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  48.41 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  47.67 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.9 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.35 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 254 aa  215  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  48.05 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  45.89 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  48.07 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.33 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.92 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  46.36 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  48.32 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  44.18 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.78 
 
 		 272 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.78 
 
 		 272 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.94 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  42.32 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.5 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.86 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.13 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  44.05 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.39 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.68 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.39 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.17 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.97 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.75 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  50 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  43.16 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>