More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1899 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  70.75 
 
 		 265 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.77 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  51.43 
 
 		 256 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.08 
 
 		 253 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  51.46 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  50.82 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.24 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.61 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.38 
 
 		 272 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  52.05 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.38 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.76 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  50.19 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  50.19 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.61 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.58 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.33 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 		 254 aa  258  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  50.82 
 
 		 273 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.77 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51 
 
 		 273 aa  254  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.06 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.5 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.37 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.91 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.4 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.6 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.17 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.59 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.77 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.95 
 
 		 293 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.95 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  48.95 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.81 
 
 		 306 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  49.1 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  50.58 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.33 
 
 		 272 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.83 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 260 aa  245  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.41 
 
 		 267 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.41 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  48.98 
 
 		 311 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  48.41 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  49.39 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.15 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.59 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.92 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.99 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.56 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  48.16 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.48 
 
 		 304 aa  241  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.32 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  47.95 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  47.95 
 
 		 288 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.75 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.97 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  48.35 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.34 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.06 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.15 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  48.18 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.1 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  49.12 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.58 
 
 		 326 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  48.24 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  45.12 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  46.83 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  46.83 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.58 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  49.59 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.58 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.35 
 
 		 267 aa  235  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.4 
 
 		 259 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  43.64 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45 
 
 		 280 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2619  ABC transporter related  45.31 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53368  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  46.5 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.33 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  47.01 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  52.51 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  52.51 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  54.68 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>