More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4661 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  100 
 
 
326 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  96.01 
 
 
326 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  97.67 
 
 
301 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4816  ABC transporter related  80.46 
 
 
311 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  hitchhiker  0.00101166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2619  ABC transporter related  78.16 
 
 
308 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53368  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2405  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  72.7 
 
 
295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2056  ABC transporter related  77.39 
 
 
305 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5413  putative nitrate ABC transporter ATP-binding protein (ntrC/D-like protein)  77.03 
 
 
300 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2204  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  57.65 
 
 
288 aa  361  7.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2170  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.73 
 
 
308 aa  351  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0468857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3485  putative nitrate transport system ATP-binding protein  56.7 
 
 
308 aa  342  7e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3974  ABC transporter related  56.36 
 
 
292 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0320166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  59.32 
 
 
290 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0995  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.04 
 
 
287 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0290  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  54.23 
 
 
291 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  54.29 
 
 
304 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3740  ABC transporter related  56.23 
 
 
287 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.74 
 
 
263 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.64 
 
 
277 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.24 
 
 
280 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.01 
 
 
285 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.01 
 
 
285 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.72 
 
 
288 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.8 
 
 
659 aa  264  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.66 
 
 
668 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2375  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
268 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.89 
 
 
270 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
668 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.38 
 
 
267 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.22 
 
 
266 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.25 
 
 
669 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2274  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.39 
 
 
265 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362973  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0379  putative nitrate ATP-binding ABC transporter protein  50.38 
 
 
268 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.95656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50 
 
 
267 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.03 
 
 
667 aa  260  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0256  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.62 
 
 
267 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.9 
 
 
337 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.12 
 
 
266 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.47 
 
 
269 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.26 
 
 
278 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.2 
 
 
657 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1412  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.51 
 
 
271 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.867581  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.38 
 
 
286 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.47 
 
 
663 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.62 
 
 
267 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2592  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.58 
 
 
290 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0506059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3731  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.44 
 
 
274 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00678541  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.63 
 
 
275 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  48.63 
 
 
278 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  48.63 
 
 
278 aa  255  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3841  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.66 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3677  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.05 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.7 
 
 
668 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.7 
 
 
668 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2556  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.6 
 
 
274 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.140772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2322  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.42 
 
 
267 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237754  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.44 
 
 
669 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.44 
 
 
669 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0642  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.59 
 
 
281 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49.22 
 
 
268 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2833  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.03 
 
 
267 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.24141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.58 
 
 
280 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.58 
 
 
280 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03652  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  48.08 
 
 
295 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.48 
 
 
673 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1155  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  47.53 
 
 
264 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.06 
 
 
278 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1390  NO3-/NO2- ABC transporter  48.24 
 
 
266 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2817  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.84 
 
 
282 aa  245  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.042803  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.06 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2820  nitrate transport protein  49.79 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2415  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.56 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.247099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.88 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1117  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.88 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.23 
 
 
257 aa  242  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2145  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.04 
 
 
270 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2502  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.33 
 
 
264 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541276  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3745  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.87 
 
 
264 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6459  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.95 
 
 
265 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.56 
 
 
264 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.4 
 
 
276 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4957  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.28 
 
 
264 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0893912  normal  0.168509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5895  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  47.91 
 
 
267 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0163214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4494  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  52.28 
 
 
264 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.87 
 
 
264 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.45 
 
 
557 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2266  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.83 
 
 
587 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.278164  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2907  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.27 
 
 
262 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.98485  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4472  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.79 
 
 
265 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.75399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3314  putative nitrate ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
292 aa  235  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.58 
 
 
264 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.93 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.56 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1966  ABC type nitrate transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.7754  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1705  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.24 
 
 
263 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3655  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.27 
 
 
263 aa  232  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
265 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1665  ABC transporter  45.28 
 
 
561 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0690908  normal  0.0741534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  50 
 
 
265 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1967  ABC-type nitrate transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
293 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.528623  normal  0.207247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>