More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
255 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  61.04 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  59.3 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  62.5 
 
 
286 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.38 
 
 
281 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  60.98 
 
 
281 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  60.98 
 
 
281 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  60.98 
 
 
281 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  60.49 
 
 
281 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  58.5 
 
 
269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  61.92 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  58.47 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  58.02 
 
 
271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  60.33 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  60.92 
 
 
298 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  58.61 
 
 
287 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  58.61 
 
 
287 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  55.6 
 
 
261 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  57.26 
 
 
269 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 
284 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  56.85 
 
 
278 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  56.68 
 
 
262 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 
279 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  57.08 
 
 
276 aa  265  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  53.39 
 
 
255 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  56.07 
 
 
269 aa  261  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  56.61 
 
 
286 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  52.05 
 
 
259 aa  259  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  56.12 
 
 
266 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  55.74 
 
 
267 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  60.25 
 
 
261 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.21 
 
 
251 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  54.88 
 
 
260 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  52.03 
 
 
262 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  53.85 
 
 
259 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  53.75 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  52.4 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  51.74 
 
 
663 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.56 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
251 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 
253 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  49.59 
 
 
262 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.54 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  53.97 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  48.76 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.69 
 
 
258 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  55.13 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50.58 
 
 
668 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.28 
 
 
254 aa  238  8e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
267 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.15 
 
 
252 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.2 
 
 
254 aa  234  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.93 
 
 
254 aa  234  8e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  51.45 
 
 
252 aa  234  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50.61 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45.04 
 
 
251 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.64 
 
 
673 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  52.92 
 
 
262 aa  232  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
308 aa  232  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 
251 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.08 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.99 
 
 
267 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.3 
 
 
267 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
255 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  48.77 
 
 
256 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.41 
 
 
274 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 
276 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  52.77 
 
 
273 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  52.77 
 
 
273 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50 
 
 
276 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
265 aa  228  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.49 
 
 
669 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  51.43 
 
 
261 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.49 
 
 
669 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.13 
 
 
272 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
287 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.11 
 
 
306 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  50.83 
 
 
270 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  51.91 
 
 
271 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.65 
 
 
275 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  51.88 
 
 
262 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.18 
 
 
257 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.33 
 
 
246 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.81 
 
 
668 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  52.14 
 
 
264 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.18 
 
 
253 aa  226  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.9 
 
 
260 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50.21 
 
 
280 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  46.72 
 
 
256 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  51.61 
 
 
274 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.66 
 
 
304 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>