More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6193 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  100 
 
 		 332 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  97.59 
 
 		 332 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  97.59 
 
 		 332 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  87.93 
 
 		 336 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  87.82 
 
 		 313 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  79.3 
 
 		 308 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  80 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  80 
 
 		 279 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  81.89 
 
 		 276 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  74.07 
 
 		 291 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  73.88 
 
 		 286 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  71.48 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  74.71 
 
 		 298 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  74.03 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  72.33 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  70.3 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  76.08 
 
 		 287 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  76.08 
 
 		 287 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  74.81 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  74.81 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  74.81 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  74.81 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  74.81 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  76.08 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  74.81 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  75.79 
 
 		 286 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  71.86 
 
 		 282 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  76.59 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  75.86 
 
 		 578 aa  362  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  70.73 
 
 		 278 aa  361  8e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  62.26 
 
 		 313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.22 
 
 		 276 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  61.6 
 
 		 258 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  67.69 
 
 		 259 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  63.45 
 
 		 256 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  63.82 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  63.82 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  61.09 
 
 		 271 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  60.32 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  66.82 
 
 		 256 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  61 
 
 		 272 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  61.33 
 
 		 256 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  63.41 
 
 		 261 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 		 254 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 265 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  59.35 
 
 		 271 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  63.32 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  55.94 
 
 		 282 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  54.68 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  53.3 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 264 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.93 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  55.28 
 
 		 264 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.98 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.47 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  51.48 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.34 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.92 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.54 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  51.15 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  50.75 
 
 		 256 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.66 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  53.27 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.16 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.16 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.27 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.77 
 
 		 274 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  50.45 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.76 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.54 
 
 		 262 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  52.56 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  51.38 
 
 		 267 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.84 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.23 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  51.71 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  51.85 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  50.69 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  51.15 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.4 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  40.54 
 
 		 279 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 272 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.72 
 
 		 266 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 260 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.92 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.12 
 
 		 272 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.09 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 259 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>