More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2035 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  99.28 
 
 
276 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  99.28 
 
 
276 aa  547  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  99.28 
 
 
276 aa  547  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  99.28 
 
 
276 aa  547  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  99.28 
 
 
276 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  73.36 
 
 
276 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  73.72 
 
 
279 aa  410  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  71.69 
 
 
276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  79.2 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  78 
 
 
313 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  75.39 
 
 
332 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  76.8 
 
 
336 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  75.39 
 
 
332 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  75.39 
 
 
332 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  71.7 
 
 
291 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  71.48 
 
 
286 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  72.41 
 
 
279 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  68.89 
 
 
282 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  69.2 
 
 
298 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  72.58 
 
 
276 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  69.85 
 
 
286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  75.11 
 
 
578 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  70.33 
 
 
288 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  71.89 
 
 
287 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  71.49 
 
 
287 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  69.51 
 
 
284 aa  349  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  71.08 
 
 
287 aa  348  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  68.32 
 
 
313 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  71.77 
 
 
287 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  65.85 
 
 
278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  63.49 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  69.23 
 
 
259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  63.82 
 
 
256 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  67.42 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  60.24 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.24 
 
 
276 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
254 aa  305  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  55.81 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  64 
 
 
264 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  64 
 
 
264 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  60 
 
 
271 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  63.93 
 
 
272 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  64.16 
 
 
261 aa  294  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  56.2 
 
 
265 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  57.71 
 
 
265 aa  277  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  52.79 
 
 
282 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.29 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  53.03 
 
 
264 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.56 
 
 
307 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
278 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 
264 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  53.77 
 
 
264 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.54 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.08 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  42.91 
 
 
272 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.77 
 
 
271 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  52.29 
 
 
311 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.59 
 
 
271 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  52.04 
 
 
262 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 
265 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
261 aa  207  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.59 
 
 
271 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  50.92 
 
 
311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  52.58 
 
 
260 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 
276 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.15 
 
 
306 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.92 
 
 
283 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  43.56 
 
 
262 aa  205  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.5 
 
 
274 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.15 
 
 
308 aa  205  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.06 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.23 
 
 
272 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.62 
 
 
267 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.17 
 
 
266 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.64 
 
 
278 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  38.59 
 
 
256 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  51.27 
 
 
304 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.46 
 
 
292 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.98 
 
 
260 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  47.13 
 
 
258 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.91 
 
 
274 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.68 
 
 
261 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 
254 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.84 
 
 
272 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
290 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  45.76 
 
 
239 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.22 
 
 
272 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  52.55 
 
 
260 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  52.04 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.25 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.77 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.19 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.33 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>