More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  100 
 
 		 282 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0139  ABC transporter-like  80.78 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  75.52 
 
 		 286 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0338  ABC transporter  78.89 
 
 		 291 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0171  ABC transporter ATP-binding protein  82.02 
 
 		 287 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0192  ABC transporter related  80.29 
 
 		 287 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0190  ABC transporter related  81.27 
 
 		 287 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746927  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30910  ABC transporter, ATP-binding protein  79.53 
 
 		 276 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5056  ABC transporter related  80.52 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  73.41 
 
 		 279 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1398  ABC transporter related  75.1 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  73.93 
 
 		 276 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  75.81 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  74.9 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1796  ABC transporter related protein  73.93 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  72.76 
 
 		 276 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  71.54 
 
 		 298 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  73.2 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  71.05 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  72.8 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  71.05 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  71.86 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0820  ABC transporter, ATP-binding protein  69.63 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0513  ABC transporter related  69.81 
 
 		 313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1880  ABC transporter, ATP-binding protein  69.63 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1685  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  69.63 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0341  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  69.63 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1868  ABC transporter, ATP-binding protein  69.63 
 
 		 276 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2035  ABC transporter, ATP-binding protein  68.89 
 
 		 276 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.9269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  75 
 
 		 578 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1298  ABC transporter related  68.65 
 
 		 278 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0056  ABC transporter related  65.13 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0056  ABC transporter related  65.88 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6692  putative ABC transporter (ATP binding subunit)  62.9 
 
 		 259 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1121  ABC transporter related  57.84 
 
 		 292 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0537  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 		 254 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  62.15 
 
 		 276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3891  ABC transporter related  62.15 
 
 		 258 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524263  normal  0.0369893 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  60.61 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  60.61 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4372  ABC transporter related  64.54 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  61.39 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6245  ABC transporter related  63.01 
 
 		 272 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  61.9 
 
 		 271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1583  ABC transporter related  58.24 
 
 		 271 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4506  ABC transporter related  57.09 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3454  ABC transporter related  54.14 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4889  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  54.04 
 
 		 264 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  55.05 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.66 
 
 		 283 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.88 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.65 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.54 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  52.94 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  53.3 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.95 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  52.36 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  41.45 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.09 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  43.75 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.62 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.96 
 
 		 263 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.82 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.46 
 
 		 276 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.99 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.01 
 
 		 256 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.76 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50.45 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 256 aa  205  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.37 
 
 		 291 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.2 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.29 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  54.11 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.45 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.65 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.73 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.5 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  51.39 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  51.14 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.93 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.55 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  54.08 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.23 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>