More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5577 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  72.8 
 
 
263 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  55.91 
 
 
258 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  57.42 
 
 
263 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  60.92 
 
 
270 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  57.25 
 
 
265 aa  291  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 
271 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  57.03 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  57.03 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  57.03 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  56.64 
 
 
262 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  54.79 
 
 
271 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  55.73 
 
 
265 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.27 
 
 
264 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  56.52 
 
 
265 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  56.52 
 
 
265 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  54.69 
 
 
262 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  57.5 
 
 
270 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  50.74 
 
 
279 aa  275  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  57.26 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  59.5 
 
 
263 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
260 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
260 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
260 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
260 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
260 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
260 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  55.33 
 
 
262 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 
261 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  56.07 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  54.51 
 
 
262 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  54.1 
 
 
262 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  54.03 
 
 
255 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  53.7 
 
 
263 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
255 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
255 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 
255 aa  259  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  48.79 
 
 
255 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 
255 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  48.79 
 
 
255 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  48.79 
 
 
255 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  57.02 
 
 
269 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  52.87 
 
 
264 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  49.19 
 
 
255 aa  255  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  48.79 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  48.79 
 
 
255 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
255 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  48.79 
 
 
255 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  55.61 
 
 
263 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  54.67 
 
 
263 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  54.1 
 
 
262 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  46.88 
 
 
268 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
261 aa  238  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.85 
 
 
293 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  54.07 
 
 
283 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.28 
 
 
266 aa  234  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
253 aa  234  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.86 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.05 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  52.44 
 
 
293 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.63 
 
 
285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.81 
 
 
262 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  56.86 
 
 
257 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
278 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50.41 
 
 
259 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.82 
 
 
261 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
252 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.43 
 
 
292 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  47.43 
 
 
262 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  53.52 
 
 
267 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.59 
 
 
267 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 
264 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  51.9 
 
 
258 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  53.52 
 
 
267 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.66 
 
 
280 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.88 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  46.88 
 
 
278 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.03 
 
 
259 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.14 
 
 
254 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
275 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  52.13 
 
 
263 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.22 
 
 
259 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  51.6 
 
 
291 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.68 
 
 
276 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  53.39 
 
 
279 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.45 
 
 
261 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
267 aa  222  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 
276 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  54.77 
 
 
286 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.64 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  55.56 
 
 
286 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.94 
 
 
276 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  49.34 
 
 
255 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.13 
 
 
279 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  49.38 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  46.53 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.65 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>