More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0430 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  99.61 
 
 
255 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  98.43 
 
 
255 aa  507  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  98.43 
 
 
255 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  98.82 
 
 
255 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  98.43 
 
 
255 aa  507  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  98.43 
 
 
255 aa  507  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  98.43 
 
 
255 aa  507  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  87.06 
 
 
255 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  69.69 
 
 
255 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  67.72 
 
 
255 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  67.72 
 
 
255 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  67.72 
 
 
255 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 
262 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 
262 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 
262 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 
264 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 
261 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 
262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.96 
 
 
264 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
263 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  53.39 
 
 
263 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 
260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  52.63 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  51 
 
 
258 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  53.6 
 
 
262 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
260 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  54.08 
 
 
271 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  51.63 
 
 
265 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  53.65 
 
 
271 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.41 
 
 
263 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  53.56 
 
 
269 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  50.58 
 
 
265 aa  258  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  51.63 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  51.63 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  51.63 
 
 
265 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  53.67 
 
 
262 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  51.6 
 
 
265 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  52.16 
 
 
259 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  51.81 
 
 
263 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  48.39 
 
 
262 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.81 
 
 
265 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  50 
 
 
270 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  49.6 
 
 
270 aa  248  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 
264 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  50 
 
 
279 aa  244  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  44.81 
 
 
268 aa  224  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  46.86 
 
 
278 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.73 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  48.03 
 
 
290 aa  218  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.3 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.42 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  45.93 
 
 
257 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.58 
 
 
251 aa  215  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.38 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  49.07 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.78 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.12 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  43.83 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.49 
 
 
280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.08 
 
 
297 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  45.81 
 
 
301 aa  211  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  44.68 
 
 
274 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.39 
 
 
263 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.48 
 
 
263 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.44 
 
 
254 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.68 
 
 
292 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.65 
 
 
283 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.09 
 
 
259 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  42.79 
 
 
273 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.51 
 
 
282 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.55 
 
 
258 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
261 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  45.85 
 
 
293 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.46 
 
 
278 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  45.85 
 
 
293 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.53 
 
 
261 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45 
 
 
273 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.61 
 
 
257 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.49 
 
 
253 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.62 
 
 
253 aa  206  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.07 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
260 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.15 
 
 
260 aa  206  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.12 
 
 
275 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.25 
 
 
280 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
264 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.06 
 
 
285 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.06 
 
 
285 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  45.41 
 
 
283 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>