More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0232 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 262 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  99.24 
 
 		 262 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  97.71 
 
 		 262 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  95.42 
 
 		 262 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  84.85 
 
 		 264 aa  447  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  82.63 
 
 		 261 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  66.8 
 
 		 255 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  65.62 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  64.45 
 
 		 255 aa  329  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  64.06 
 
 		 255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  64.06 
 
 		 255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  64.06 
 
 		 255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  63.67 
 
 		 255 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 		 255 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 		 255 aa  322  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 		 255 aa  321  8e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  58.1 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  58.1 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  59.36 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  57.31 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  57.31 
 
 		 265 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  57.31 
 
 		 265 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.59 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  56.05 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  54.98 
 
 		 259 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  53.64 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  55.14 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  51.72 
 
 		 270 aa  272  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  53.85 
 
 		 265 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  55.74 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  53.44 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  53.78 
 
 		 258 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  52.8 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  55.74 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  54.1 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  50.77 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  50.76 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  54.9 
 
 		 263 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  47.97 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.22 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  45.59 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  43.4 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.02 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 		 278 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.94 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  48.9 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.09 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  43.56 
 
 		 273 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  47.11 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.73 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.79 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  48.23 
 
 		 285 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  44 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  44.76 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  51.26 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.29 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  43.61 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.01 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.19 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.5 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.26 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.23 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.85 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.98 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.4 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  47.28 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  47.28 
 
 		 293 aa  204  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  41.53 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.94 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.05 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.17 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  41.94 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.33 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.74 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  44.72 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>