More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3937 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  85.1 
 
 		 255 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  69.69 
 
 		 255 aa  358  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  68.5 
 
 		 255 aa  354  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  68.5 
 
 		 255 aa  354  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  68.5 
 
 		 255 aa  354  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  68.11 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  68.11 
 
 		 255 aa  352  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  68.11 
 
 		 255 aa  351  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  67.72 
 
 		 255 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  67.72 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  66.41 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  64.84 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  63.67 
 
 		 262 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 261 aa  321  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  64.45 
 
 		 262 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.45 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  58.65 
 
 		 264 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.6 
 
 		 260 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  56.18 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  57.69 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  55.47 
 
 		 270 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  55.79 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  52.59 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  54.25 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  55.79 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  51.18 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  51.18 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  51.18 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  54.04 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  53.5 
 
 		 262 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  51.35 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.39 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  52.03 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 		 263 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.5 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  51.95 
 
 		 262 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  51.35 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  49.2 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.77 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  48.25 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  52.84 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  50 
 
 		 262 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  47.08 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  47.5 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.71 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.8 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.44 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.63 
 
 		 292 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.55 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.44 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.35 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  52.97 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.08 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.55 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.55 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  53.5 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50 
 
 		 261 aa  215  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.83 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.14 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.72 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.5 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.91 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  51 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  49.48 
 
 		 286 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.67 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  49.1 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 		 260 aa  210  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.81 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.54 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  49.76 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 		 259 aa  208  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  43.22 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.44 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.84 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.5 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>