More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4860 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  87.41 
 
 		 270 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  80.77 
 
 		 271 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  79.23 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  63.27 
 
 		 279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  61.15 
 
 		 262 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  59.62 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  62.25 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  59.14 
 
 		 258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  60.56 
 
 		 259 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  58.69 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  58.3 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  58.3 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  57.94 
 
 		 265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  58.69 
 
 		 265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  57.94 
 
 		 265 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  58.59 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  59.69 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  58.59 
 
 		 263 aa  291  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  56.69 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.45 
 
 		 264 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.44 
 
 		 263 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  57.5 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  53.36 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  54.25 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  54.25 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  54.25 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  51.53 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  51.15 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  50.76 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  51.17 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  49.42 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  50.63 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  50.63 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  50 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  49.6 
 
 		 255 aa  248  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  48.66 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  50.38 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.41 
 
 		 257 aa  235  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 261 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.09 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.63 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.54 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 264 aa  224  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.75 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  45.53 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  43.95 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.94 
 
 		 258 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  52.31 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  48.24 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.91 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  44.62 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  44.44 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.68 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  42.35 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.3 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.27 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  41.27 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.02 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.63 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.2 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  44.35 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.55 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  52.45 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.96 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.63 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  48.75 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.98 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.81 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.48 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.19 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.06 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  47.72 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>