More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2895 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  99.62 
 
 		 265 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  99.62 
 
 		 265 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  96.92 
 
 		 265 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  92.45 
 
 		 265 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  77.73 
 
 		 265 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  77.73 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  73.58 
 
 		 259 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  74.22 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  70.82 
 
 		 263 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  70.82 
 
 		 263 aa  348  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  66.02 
 
 		 258 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  61.3 
 
 		 271 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  62.45 
 
 		 262 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  62.45 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  60.54 
 
 		 271 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  61.39 
 
 		 270 aa  325  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  56.36 
 
 		 279 aa  315  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  62.3 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  58.69 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  64.8 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  60.64 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  57.31 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  57.31 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  54.89 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  57.03 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.81 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.73 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  55.34 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 260 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  57.31 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  53.6 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  51.18 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  51.18 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  51.18 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.03 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.03 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.03 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  52.03 
 
 		 255 aa  261  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  51.63 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  51.63 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  52.03 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  50.4 
 
 		 255 aa  254  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  49.41 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  50.59 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  52.11 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.8 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.27 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.42 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  50 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.4 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.79 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.92 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.43 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.97 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.24 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.59 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.03 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.25 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.27 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.25 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.83 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.68 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.88 
 
 		 303 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.06 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.1 
 
 		 307 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.41 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.21 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.85 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  52.89 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.43 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.67 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 263 aa  225  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.19 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  224  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.8 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.74 
 
 		 286 aa  224  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.85 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.85 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.02 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.48 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.36 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.85 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  54.59 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>