More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3180 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  56.3 
 
 
259 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 
281 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  55.51 
 
 
259 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  61.02 
 
 
271 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  55.34 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  56.57 
 
 
271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  53.2 
 
 
276 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  50.99 
 
 
262 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  50.79 
 
 
267 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  48.41 
 
 
262 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  47.6 
 
 
275 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.19 
 
 
257 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  47.22 
 
 
284 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  48.37 
 
 
272 aa  243  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  48.18 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.19 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
261 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  50.88 
 
 
258 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  53.07 
 
 
251 aa  240  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  51.9 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.58 
 
 
273 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 
254 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
271 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.75 
 
 
261 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  50.21 
 
 
271 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  53.7 
 
 
288 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.97 
 
 
269 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.98 
 
 
274 aa  236  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.88 
 
 
252 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
278 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.25 
 
 
289 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.15 
 
 
278 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.52 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.15 
 
 
307 aa  234  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  51.71 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.61 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.59 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.61 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.53 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  50.93 
 
 
258 aa  232  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  49.34 
 
 
263 aa  232  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.12 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 
253 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  48.37 
 
 
263 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.89 
 
 
330 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.34 
 
 
263 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50 
 
 
264 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.77 
 
 
304 aa  228  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.44 
 
 
291 aa  228  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.09 
 
 
259 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.78 
 
 
261 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.91 
 
 
292 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.25 
 
 
280 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.22 
 
 
257 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  50.87 
 
 
274 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.79 
 
 
260 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
290 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  47.48 
 
 
301 aa  226  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  46.09 
 
 
265 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50 
 
 
274 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  51.6 
 
 
276 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.97 
 
 
261 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  51.9 
 
 
284 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.11 
 
 
259 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  48.73 
 
 
272 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  48.92 
 
 
281 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
276 aa  224  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.96 
 
 
262 aa  224  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
278 aa  224  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.37 
 
 
253 aa  224  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.52 
 
 
244 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
426 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.02 
 
 
252 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.4 
 
 
260 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
259 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.51 
 
 
246 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.45 
 
 
259 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.2 
 
 
259 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  51.09 
 
 
295 aa  221  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
281 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  50 
 
 
263 aa  221  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  45.31 
 
 
266 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  44.92 
 
 
333 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  45.42 
 
 
260 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  47.03 
 
 
286 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.86 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  48.98 
 
 
282 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.65 
 
 
283 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  47.88 
 
 
280 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.91 
 
 
259 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.86 
 
 
303 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  46.55 
 
 
266 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
261 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.89 
 
 
254 aa  217  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.86 
 
 
303 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.86 
 
 
303 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>