More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0762 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  100 
 
 
278 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  61.57 
 
 
268 aa  344  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  53.76 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  49.25 
 
 
271 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  51.72 
 
 
262 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  49.62 
 
 
271 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  49.81 
 
 
270 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  51.18 
 
 
258 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  51.35 
 
 
262 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  52.78 
 
 
265 aa  254  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  49.42 
 
 
270 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  51.32 
 
 
265 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  51.76 
 
 
265 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.96 
 
 
264 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 
265 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  52 
 
 
259 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  50.59 
 
 
265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  48.85 
 
 
263 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  50.2 
 
 
265 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  50.2 
 
 
265 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  52.59 
 
 
264 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  45.32 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  50 
 
 
269 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 
260 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.46 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  45.59 
 
 
262 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  45.59 
 
 
262 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
261 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  48.08 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  52.86 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
261 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  51.12 
 
 
267 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
255 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
255 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
255 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  49.24 
 
 
263 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
263 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.22 
 
 
263 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 
278 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 
262 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.28 
 
 
292 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  46.47 
 
 
253 aa  226  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  45.2 
 
 
283 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  47.7 
 
 
255 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.91 
 
 
283 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  47.7 
 
 
255 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  47.7 
 
 
255 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
264 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  46.88 
 
 
262 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.23 
 
 
260 aa  225  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  47.77 
 
 
271 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.74 
 
 
267 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.4 
 
 
278 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.93 
 
 
262 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  42.02 
 
 
278 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46 
 
 
274 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  50.23 
 
 
259 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
267 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  47.48 
 
 
255 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.36 
 
 
258 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.42 
 
 
258 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 
264 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.31 
 
 
272 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.16 
 
 
267 aa  222  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
272 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.79 
 
 
280 aa  222  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  51.09 
 
 
267 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.66 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 
255 aa  222  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.46 
 
 
263 aa  221  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 
265 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.23 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  46.86 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.88 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  48.87 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
261 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  42.69 
 
 
273 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  48.61 
 
 
259 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  50.24 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  46.86 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.47 
 
 
279 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.83 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.45 
 
 
285 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
254 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.83 
 
 
254 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.18 
 
 
287 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>