More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3845 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  83.14 
 
 		 262 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  69.14 
 
 		 258 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  63.26 
 
 		 271 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  62.88 
 
 		 271 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  64.98 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  63.12 
 
 		 270 aa  331  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  62.74 
 
 		 265 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  62.45 
 
 		 265 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  62.45 
 
 		 265 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  62.45 
 
 		 265 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  63.85 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 		 265 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  61.92 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  64.71 
 
 		 264 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  62.21 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  61.15 
 
 		 270 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  65.37 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  62.7 
 
 		 263 aa  318  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  58.21 
 
 		 279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  63.45 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.29 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.2 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  56.64 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.9 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.9 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.9 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  54 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  51.54 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  54 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  54 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  51.72 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  53.6 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  53.6 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  51.15 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 262 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  52.53 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  50.19 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  50.38 
 
 		 264 aa  251  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  50.19 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  50.77 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  49.05 
 
 		 263 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.91 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  45.45 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  45.42 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.57 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.62 
 
 		 251 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.28 
 
 		 262 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.83 
 
 		 261 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.2 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.69 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.19 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  43.8 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.46 
 
 		 282 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.09 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.48 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.23 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.04 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.63 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.69 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.53 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.77 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.75 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  45.91 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.58 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.56 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 261 aa  222  6e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.56 
 
 		 303 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.15 
 
 		 292 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.7 
 
 		 286 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.12 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.43 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.97 
 
 		 285 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.17 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.97 
 
 		 285 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  41.41 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.53 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0928841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>