More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4208 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  96.23 
 
 
265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  77.73 
 
 
265 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  75.85 
 
 
265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  78.12 
 
 
265 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  77.73 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  77.73 
 
 
265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  76.63 
 
 
259 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  79.69 
 
 
264 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  69.92 
 
 
258 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  66.28 
 
 
263 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  62.26 
 
 
271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  60.55 
 
 
271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  63.71 
 
 
262 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  67.32 
 
 
263 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  63.26 
 
 
262 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  63.49 
 
 
263 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  61.11 
 
 
270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  56.62 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  63.45 
 
 
269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  57.94 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  58.55 
 
 
264 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.5 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  56.52 
 
 
262 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 
262 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  54.23 
 
 
262 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  53.85 
 
 
262 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 
260 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  52.16 
 
 
264 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 
261 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  49.42 
 
 
255 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  50.19 
 
 
255 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  50.19 
 
 
255 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  50.19 
 
 
255 aa  255  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  52.78 
 
 
278 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  50.19 
 
 
255 aa  254  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  53.46 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  50.19 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 
255 aa  251  7e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  50.19 
 
 
255 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  49.81 
 
 
255 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  49.43 
 
 
268 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 
255 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 
255 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 
255 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  51.09 
 
 
256 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.59 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 
263 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  46.12 
 
 
266 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.27 
 
 
254 aa  234  8e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.42 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.49 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.49 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.2 
 
 
262 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 
261 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.36 
 
 
254 aa  230  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  53.12 
 
 
282 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  46.9 
 
 
258 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.88 
 
 
258 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.7 
 
 
256 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.88 
 
 
251 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.83 
 
 
283 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
278 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.24 
 
 
267 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.15 
 
 
274 aa  225  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.12 
 
 
267 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.45 
 
 
279 aa  224  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.02 
 
 
267 aa  224  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.29 
 
 
264 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49 
 
 
269 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.73 
 
 
286 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.95 
 
 
297 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  54.19 
 
 
255 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50 
 
 
290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  48.08 
 
 
285 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.24 
 
 
267 aa  221  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
259 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.7 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  54.87 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.16 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
263 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.7 
 
 
280 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.48 
 
 
260 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.75 
 
 
286 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.78 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  50.43 
 
 
295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  48.9 
 
 
245 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  53.14 
 
 
271 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  47.16 
 
 
301 aa  218  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>