More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2536 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  61.35 
 
 		 263 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  58.33 
 
 		 262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.77 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  61.34 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  60.64 
 
 		 265 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  61.51 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  57.69 
 
 		 264 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  57.58 
 
 		 262 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  57.2 
 
 		 262 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  61.54 
 
 		 271 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  60.24 
 
 		 265 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  60.24 
 
 		 265 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  60.24 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  57.03 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  57.2 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  60.68 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  54.24 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.42 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  57.14 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  60.08 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  63.2 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  56.27 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  55.25 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  58.97 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  59.26 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  58.55 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  56.45 
 
 		 270 aa  285  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  58.54 
 
 		 269 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  58.65 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  58.65 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  58.65 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  56.82 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  57.38 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  57.38 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  57.38 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  57.63 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  57.38 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 255 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  56.96 
 
 		 255 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  57.38 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  60.08 
 
 		 263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  53.12 
 
 		 255 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 263 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.4 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  50.96 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  50.8 
 
 		 285 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  48.06 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.8 
 
 		 282 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  54.46 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.9 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.79 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48 
 
 		 267 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 267 aa  234  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.16 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.08 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.97 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  50 
 
 		 293 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  50 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.58 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  46.83 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  54.46 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  55.3 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.55 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.72 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.7 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.92 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.95 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 272 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  49.01 
 
 		 253 aa  222  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  53.69 
 
 		 253 aa  222  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.88 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.09 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  54.85 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.36 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.13 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.42 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.98 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  51.63 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.44 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.96 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.14 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.67 
 
 		 264 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>