More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0508 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  96.23 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  77.65 
 
 		 265 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  76.43 
 
 		 265 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  80.08 
 
 		 264 aa  400  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  77.73 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  77.73 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  77.73 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  77.43 
 
 		 259 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  69.53 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  65.9 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  63.85 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  60.94 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  67.32 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  66.39 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  63.89 
 
 		 263 aa  315  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  61.51 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  56.25 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  63.45 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  57.94 
 
 		 270 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  58.97 
 
 		 264 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.89 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  56.52 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  53.64 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  54.02 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  53.64 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  50.97 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  50.97 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  50.97 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  51.35 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 		 255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  50.97 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  53.26 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  50.58 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  48.64 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  51.32 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  48.25 
 
 		 255 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  48.25 
 
 		 255 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  48.25 
 
 		 255 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  50.79 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  54.82 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.59 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.06 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.27 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.27 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.09 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.78 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  54.42 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.81 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  51.41 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.43 
 
 		 263 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.28 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  53.12 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.09 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.64 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55.39 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.41 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.65 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  53.88 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  50.62 
 
 		 295 aa  221  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.48 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.41 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  46.12 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  52.36 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.63 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.92 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.59 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.6 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  43.3 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  49.78 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.18 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  53.23 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.8 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.43 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.14 
 
 		 286 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  47.22 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.24 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>