More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7587 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  100 
 
 		 258 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  64.59 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 264 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  52.49 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.99 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.2 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  51.15 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.8 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  50.79 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  51.53 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  54.39 
 
 		 292 aa  244  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  50 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.1 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.22 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.2 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 256 aa  242  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  51.41 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.61 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  51.72 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  52.11 
 
 		 265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  52.59 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.6 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.41 
 
 		 253 aa  238  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.63 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.26 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 		 265 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  51.72 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  51.72 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.58 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  51.15 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 261 aa  235  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.8 
 
 		 288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.86 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.86 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.97 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  50.41 
 
 		 275 aa  234  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.2 
 
 		 286 aa  232  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  49.33 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  51.46 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  50.99 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.25 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.35 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.66 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.1 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.19 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.03 
 
 		 259 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.57 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 263 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.33 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.4 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.05 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  50.45 
 
 		 259 aa  228  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.4 
 
 		 291 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.95 
 
 		 263 aa  228  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  46.51 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  47.45 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  49.55 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  48.24 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  53.95 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.9 
 
 		 274 aa  225  7e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  48.63 
 
 		 265 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  50 
 
 		 269 aa  224  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.28 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  46.9 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  50.88 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  47.64 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.37 
 
 		 267 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 271 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 		 271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.24 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  45.7 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.83 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  46.27 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  50.89 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.8 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.37 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.67 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  49.36 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  45.6 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  50.86 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.88 
 
 		 287 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.43 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.93 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.3 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  47.41 
 
 		 262 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.8 
 
 		 255 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.25 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  45.59 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.75 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.55 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>