More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6226 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  96.54 
 
 
265 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  96.54 
 
 
265 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  96.92 
 
 
265 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  93.82 
 
 
265 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  75.85 
 
 
265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  76.43 
 
 
265 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  73.83 
 
 
259 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  74.22 
 
 
264 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  70.7 
 
 
263 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  70.08 
 
 
263 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  66.02 
 
 
258 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  62.64 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  61.89 
 
 
271 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  62.74 
 
 
262 aa  330  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  62.45 
 
 
270 aa  329  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  62.88 
 
 
262 aa  328  5.0000000000000004e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  55.96 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  62.45 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  60 
 
 
270 aa  309  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  63.12 
 
 
269 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  58.89 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 
264 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  58.1 
 
 
262 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  57.71 
 
 
262 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  57.25 
 
 
262 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.73 
 
 
261 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  55.17 
 
 
264 aa  289  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.63 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.36 
 
 
260 aa  284  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.36 
 
 
260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  57.71 
 
 
262 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  53.49 
 
 
255 aa  279  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
255 aa  271  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
255 aa  271  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  52.59 
 
 
255 aa  271  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.03 
 
 
255 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.03 
 
 
255 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.03 
 
 
255 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  52.03 
 
 
255 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  52.03 
 
 
255 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  51.63 
 
 
255 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  51.63 
 
 
255 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  52.03 
 
 
255 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
255 aa  258  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  52.27 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  52.27 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.69 
 
 
261 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  50.19 
 
 
278 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  49.8 
 
 
268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  50.79 
 
 
267 aa  239  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  51.19 
 
 
267 aa  238  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.66 
 
 
266 aa  238  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.41 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 
259 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.57 
 
 
258 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
256 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.59 
 
 
262 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.62 
 
 
259 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  47.62 
 
 
261 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 
253 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.43 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  50 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.04 
 
 
285 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.62 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.2 
 
 
273 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.6 
 
 
260 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  53.12 
 
 
282 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1305  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.62 
 
 
326 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1146  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.62 
 
 
301 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  0.976789 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.83 
 
 
304 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4661  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.62 
 
 
326 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.55 
 
 
304 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.68 
 
 
260 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.67 
 
 
288 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.29 
 
 
280 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  53.31 
 
 
293 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.49 
 
 
307 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.8 
 
 
280 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
263 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.22 
 
 
304 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.58 
 
 
254 aa  227  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.45 
 
 
303 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.45 
 
 
303 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
278 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.45 
 
 
303 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  55.61 
 
 
255 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.89 
 
 
293 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  50 
 
 
271 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.66 
 
 
256 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.13 
 
 
251 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.25 
 
 
258 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>