More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0395 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  98.82 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  98.43 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  97.65 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  97.65 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  97.65 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  97.65 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  98.04 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  87.06 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  70.08 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  68.11 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  68.11 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  68.11 
 
 		 255 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  62.89 
 
 		 262 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  61.57 
 
 		 264 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  63.28 
 
 		 262 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  57.38 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  54.17 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  53.78 
 
 		 263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  51.41 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  53.04 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  53.6 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  54.51 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  54.08 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  52.03 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.81 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  50.97 
 
 		 265 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  52.03 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  52.03 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  52.03 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  52 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  53.67 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  52.55 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  52.21 
 
 		 263 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  48.79 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  50.42 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  50 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  52.82 
 
 		 264 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  50 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  43.98 
 
 		 268 aa  222  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  46.86 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.42 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  46.34 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.3 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.06 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.25 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  49.07 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.16 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.96 
 
 		 252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.68 
 
 		 278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.08 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.26 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.55 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  41.8 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  44.93 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.89 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.68 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.89 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.43 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.09 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  42.42 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  45.69 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  49.02 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50.49 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  46.29 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.19 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.83 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  42.67 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  46.29 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.06 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.28 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1491  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.67 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.495722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.61 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.67 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  45.85 
 
 		 283 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.7 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.53 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  47.53 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>